Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H3Q13889 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
GTF2H3Q13889 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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