Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
C1orf61Q13536 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
C1orf61Q13536 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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