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| PTK7 | Q13308 | SLC17A4-201 | ENST00000377905 | 3616 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL161912.2-201 | ENST00000565707 | 3007 nt | BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | CAB39L-206 | ENST00000410043 | 1627 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | VIRMA-201 | ENST00000297591 | 6528 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.61 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | C8orf34-203 | ENST00000348340 | 3571 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | PTPN22-201 | ENST00000359785 | 3654 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | N4BP2L2-202 | ENST00000357505 | 2917 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | SCN1A-202 | ENST00000375405 | 8097 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | NEGR1-201 | ENST00000306821 | 5577 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| PTK7 | Q13308 | DOCK7-218 | ENST00000635123 | 6297 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
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| PTK7 | Q13308 | CASK-207 | ENST00000421587 | 8204 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | KCNJ16-211 | ENST00000615244 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZFHX4-207 | ENST00000521891 | 14019 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC005550.3-201 | ENST00000451240 | 3743 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | ADGRG4-201 | ENST00000370652 | 9820 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | ADGRG7-202 | ENST00000475887 | 2035 nt | TSL 2 BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | MECOM-219 | ENST00000628990 | 4835 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.6 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | PCDH11X-205 | ENST00000373094 | 9179 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | PPP1R9A-202 | ENST00000340694 | 9689 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | AF117829.1-206 | ENST00000621883 | 3802 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC015813.1-202 | ENST00000577267 | 4056 nt | TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | ABI3BP-201 | ENST00000284322 | 4498 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | MS4A1-201 | ENST00000345732 | 3331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR410-201 | ENST00000362222 | 80 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1285P-201 | ENST00000363480 | 105 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-873P-201 | ENST00000363833 | 107 nt | BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ZNF638-203 | ENST00000409544 | 6821 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.67 | | |
| PTK7 | Q13308 | AP5M1-201 | ENST00000261558 | 11737 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | FMO2-201 | ENST00000209929 | 3851 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC02458-201 | ENST00000500381 | 2941 nt | TSL 2 BASIC | 4.59 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC096751.1-201 | ENST00000515178 | 2202 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | THOC1-219 | ENST00000616322 | 2078 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC010733.2-201 | ENST00000589496 | 5702 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | TMEM38B-201 | ENST00000374688 | 3956 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.275-201 | ENST00000364726 | 110 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA72.2-201 | ENST00000365028 | 127 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNY4P28-201 | ENST00000365281 | 93 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | SETP5-201 | ENST00000437270 | 562 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC010095.1-201 | ENST00000443543 | 144 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL358232.1-201 | ENST00000448030 | 501 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL121580.1-201 | ENST00000449941 | 219 nt | TSL 3 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL392046.1-203 | ENST00000450106 | 651 nt | TSL 2 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC007395.1-201 | ENST00000451333 | 677 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL441985.1-201 | ENST00000457727 | 251 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AKIRIN2P1-201 | ENST00000505898 | 352 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC020891.1-201 | ENST00000558785 | 174 nt | TSL 3 BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC012603.1-201 | ENST00000606424 | 528 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL138721.1-201 | ENST00000616756 | 179 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR6500-201 | ENST00000622700 | 86 nt | BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | ENOX2-202 | ENST00000370927 | 3788 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | GPR180-201 | ENST00000376958 | 8822 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.58 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | SLAIN2-205 | ENST00000512093 | 4219 nt | TSL 5 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | BCHE-201 | ENST00000264381 | 2454 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | SGIP1-206 | ENST00000435165 | 3646 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | TUG1-201 | ENST00000519077 | 5673 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | GABPB1-AS1-202 | ENST00000499624 | 16182 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.122-201 | ENST00000363331 | 96 nt | BASIC | 4.57 | □□□□□ -1.68 | | |