Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SRSF6Q13247 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SRSF6Q13247 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms