Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CHAF1BQ13112 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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