Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HOXC11O43248 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HOXC11O43248 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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