Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RABGEF1Q9UJ41 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms