Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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ZBED3Q96IU2 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ZBED3Q96IU2 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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