Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BCANQ96GW7 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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