Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
KNOP1Q1ED39 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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KNOP1Q1ED39 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
KNOP1Q1ED39 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
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