Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RTL8BQ17RB0 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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RTL8BQ17RB0 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
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RTL8BQ17RB0 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
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RTL8BQ17RB0 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
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RTL8BQ17RB0 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
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