Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
SNAPC1Q16533 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNAPC1Q16533 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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