Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATP6AP1Q15904 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
ATP6AP1Q15904 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms