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| ATP6AP1 | Q15904 | AC009135.1-201 | ENST00000549303 | 776 nt | TSL 2 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355076.2-202 | ENST00000553754 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PSMA3P-201 | ENST00000555485 | 635 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SUB1P2-201 | ENST00000556401 | 297 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC025811.1-201 | ENST00000604312 | 472 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL355297.2-201 | ENST00000604792 | 129 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | SMIM2-AS1-204 | ENST00000619472 | 746 nt | TSL 3 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | MIR3162-201 | ENST00000581818 | 82 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC008945.2-201 | ENST00000606056 | 604 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.783-201 | ENST00000613546 | 102 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MBNL3-212 | ENST00000538204 | 11294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ANKAR-201 | ENST00000313581 | 4391 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | SNORD56.1-201 | ENST00000362913 | 68 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Y_RNA.159-201 | ENST00000363674 | 87 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNA5SP240-201 | ENST00000365355 | 128 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RAP1BP3-201 | ENST00000407180 | 549 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC091153.2-202 | ENST00000441700 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AL353780.1-201 | ENST00000455583 | 458 nt | TSL 2 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022364.2-201 | ENST00000457963 | 554 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTCYBP40-201 | ENST00000509390 | 1135 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC026464.5-201 | ENST00000562497 | 722 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | AC068790.2-201 | ENST00000602601 | 557 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
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| ATP6AP1 | Q15904 | uc_338.15-201 | ENST00000615470 | 191 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC111000.4-202 | ENST00000505646 | 2648 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU1-23P-201 | ENST00000363361 | 144 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU6-606P-201 | ENST00000384721 | 111 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNY3P9-201 | ENST00000384727 | 106 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RPL17P50-201 | ENST00000396131 | 546 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | RNU4-46P-201 | ENST00000410818 | 138 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC009158.1-206 | ENST00000417476 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | MTCO1P19-201 | ENST00000443487 | 500 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OFD1P4Y-201 | ENST00000455273 | 1179 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | PPP1R2P5-201 | ENST00000457256 | 603 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | CYP2C59P-201 | ENST00000457790 | 269 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022272.1-201 | ENST00000503478 | 777 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC099520.1-202 | ENST00000503650 | 777 nt | TSL 3 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC010486.1-201 | ENST00000511793 | 424 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GTF2H2C-212 | ENST00000512736 | 832 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC109329.1-201 | ENST00000518744 | 317 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC021785.1-201 | ENST00000520780 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP003123.1-201 | ENST00000526041 | 333 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC118273.2-201 | ENST00000532092 | 465 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AP000873.5-201 | ENST00000533906 | 236 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AL627230.6-201 | ENST00000611129 | 280 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | AC022202.1-201 | ENST00000613515 | 211 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | C16orf97-206 | ENST00000622950 | 415 nt | TSL 2 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | Z69720.2-201 | ENST00000624755 | 279 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | OXR1-209 | ENST00000517566 | 4501 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | ZNF680P1-201 | ENST00000436625 | 1469 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| ATP6AP1 | Q15904 | GSTA3-201 | ENST00000211122 | 902 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |