Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD8Q15843 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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