Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
ODF1Q14990 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
ODF1Q14990 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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