Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
COL4A6Q14031 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
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COL4A6Q14031 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
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COL4A6Q14031 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
COL4A6Q14031 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
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