Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
NEUROD1Q13562 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NEUROD1Q13562 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms