Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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