Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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