Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
TNP2Q05952 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TNP2Q05952 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.6 ms