Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.8 ms