Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXQ1Q9C009 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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FOXQ1Q9C009 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXQ1Q9C009 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXQ1Q9C009 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXQ1Q9C009 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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FOXQ1Q9C009 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXQ1Q9C009 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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