Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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CCDC142Q17RM4 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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