Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
ECM1Q16610 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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ECM1Q16610 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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ECM1Q16610 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ECM1Q16610 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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