Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SCN9AQ15858 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SCN9AQ15858 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
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