Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PCM1Q15154 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms