Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
LAPTM4AQ15012 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
LAPTM4AQ15012 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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