Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PDE1CQ14123 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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