Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARB2Q14108 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARB2Q14108 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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