Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SPTAN1Q13813 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC-0.23□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SPTAN1Q13813 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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