Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHAF1BQ13112 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms