Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HCN3Q9P1Z3 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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