Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PHF12Q96QT6 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms