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| TMX3 | Q96JJ7 | USP12-203 | ENST00000620323 | 349 nt | TSL 3 BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ROCK1P1-203 | ENST00000608049 | 2457 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | TUSC7-203 | ENST00000477539 | 2415 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.55 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | ROS1-202 | ENST00000368508 | 7435 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.54 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | AGTR1-206 | ENST00000474935 | 1795 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | RNU4-47P-201 | ENST00000410876 | 114 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-325P-201 | ENST00000411132 | 105 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC062039.1-201 | ENST00000414394 | 565 nt | TSL 2 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | Z82205.1-201 | ENST00000428456 | 297 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
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| TMX3 | Q96JJ7 | RPL32P34-201 | ENST00000486380 | 400 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC02377-201 | ENST00000500169 | 450 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC091887.1-201 | ENST00000514002 | 439 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU4ATAC7P-201 | ENST00000516280 | 125 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ELOCP31-201 | ENST00000540463 | 467 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MAPK1-204 | ENST00000544786 | 951 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR3171-201 | ENST00000584270 | 74 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC002076.2-201 | ENST00000617362 | 122 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MAGI2-AS3-224 | ENST00000619135 | 205 nt | TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SCARNA4-202 | ENST00000625402 | 129 nt | BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NEB-204 | ENST00000409198 | 20637 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | WDFY3-AS2-202 | ENST00000451762 | 5814 nt | TSL 3 BASIC | 3.53 | □□□□□ -1.84 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MTND4P27-201 | ENST00000450813 | 1354 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LRIF1-203 | ENST00000494675 | 1912 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MAPK10-362 | ENST00000641864 | 4484 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MUC15-205 | ENST00000529533 | 2084 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | GABRG2-229 | ENST00000641017 | 3628 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-1059P-201 | ENST00000363752 | 98 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-827P-201 | ENST00000365553 | 106 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-1040P-201 | ENST00000383974 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-890P-201 | ENST00000384121 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | Y_RNA.445-201 | ENST00000384168 | 102 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNU6-1106P-201 | ENST00000390845 | 107 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNORA75.6-201 | ENST00000391318 | 127 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC006150.1-201 | ENST00000412014 | 263 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | NDUFS5P4-201 | ENST00000412983 | 318 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL451074.5-201 | ENST00000415894 | 435 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RPS15AP10-201 | ENST00000432472 | 382 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL096678.1-201 | ENST00000438877 | 472 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL390067.1-201 | ENST00000440009 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC098831.1-201 | ENST00000440661 | 216 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL357873.1-201 | ENST00000449215 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | GAS5-221 | ENST00000450589 | 632 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | SNRPGP3-201 | ENST00000469405 | 227 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ODF2L-216 | ENST00000486215 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC096576.1-201 | ENST00000489014 | 359 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC025244.2-201 | ENST00000509215 | 422 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | PTP4A1P4-201 | ENST00000512479 | 322 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | RNA5SP385-201 | ENST00000515947 | 110 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | LINC00933-203 | ENST00000559812 | 219 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | TTN-AS1-212 | ENST00000582847 | 1036 nt | TSL 5 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR3158-1-201 | ENST00000583596 | 81 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC118755.2-201 | ENST00000584676 | 212 nt | TSL 3 BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AC009314.1-201 | ENST00000603871 | 304 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR8058-201 | ENST00000615737 | 89 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR7112-201 | ENST00000616126 | 65 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | AL731566.2-201 | ENST00000618971 | 317 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | MIR7975-201 | ENST00000619350 | 68 nt | BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | FAM111A-207 | ENST00000531147 | 3996 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | CLOCK-201 | ENST00000309964 | 10304 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.52 | □□□□□ -1.85 | | |
| TMX3 | Q96JJ7 | ZNF705G-201 | ENST00000400156 | 3644 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |