Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ANKRD42Q8N9B4 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms