| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.530-201 | ENST00000384587 | 101 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-876P-201 | ENST00000391295 | 104 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL356776.1-201 | ENST00000406574 | 447 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL096701.2-201 | ENST00000416920 | 238 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | USP9YP20-201 | ENST00000419224 | 558 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPS15AP6-201 | ENST00000420703 | 385 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL157937.1-201 | ENST00000435092 | 443 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL445524.1-202 | ENST00000440665 | 416 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Z96811.1-201 | ENST00000445880 | 108 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UQCRHP3-201 | ENST00000451503 | 251 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL136164.1-201 | ENST00000456795 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU7-138P-201 | ENST00000459479 | 64 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP45-201 | ENST00000476406 | 468 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC074033.2-201 | ENST00000480669 | 535 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FAM206BP-201 | ENST00000510179 | 541 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BMPR1B-AS1-201 | ENST00000510795 | 511 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008869.1-201 | ENST00000510938 | 442 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025465.4-201 | ENST00000513422 | 638 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA43.2-201 | ENST00000516652 | 128 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1314P-201 | ENST00000517139 | 104 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SCARNA11.3-201 | ENST00000517276 | 130 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC087854.1-201 | ENST00000519706 | 414 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC090138.1-201 | ENST00000524493 | 578 nt | TSL 4 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GLYCAM1-201 | ENST00000546596 | 285 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | UBE2Q2P8-201 | ENST00000560644 | 102 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4319-201 | ENST00000577285 | 85 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC018638.8-201 | ENST00000588755 | 281 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC019159.1-201 | ENST00000605094 | 187 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC093913.1-201 | ENST00000614178 | 329 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RMST_7.1-201 | ENST00000621935 | 268 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009033.1-201 | ENST00000624279 | 431 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR7153-201 | ENST00000637758 | 57 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NOX4-202 | ENST00000343727 | 3347 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NBEAL1-203 | ENST00000449802 | 10938 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC66-201 | ENST00000326595 | 3027 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF567-201 | ENST00000360729 | 2691 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SMARCAD1-206 | ENST00000509418 | 2348 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SPAG11A-202 | ENST00000326625 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-78P-201 | ENST00000362897 | 107 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD113-7-201 | ENST00000363762 | 77 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD116-20-201 | ENST00000384529 | 92 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009411.1-202 | ENST00000412424 | 548 nt | TSL 4 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD56-201 | ENST00000413522 | 71 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL365400.1-201 | ENST00000431854 | 640 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NDUFA5P4-201 | ENST00000436704 | 385 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL031274.1-201 | ENST00000450334 | 232 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC012308.1-201 | ENST00000451232 | 178 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ODF2L-216 | ENST00000486215 | 311 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BTF3P12-201 | ENST00000519620 | 469 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | POC1B-211 | ENST00000549504 | 581 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC079600.2-201 | ENST00000550076 | 130 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PSMA3P-201 | ENST00000555485 | 635 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01195-201 | ENST00000570118 | 451 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC009163.5-201 | ENST00000575421 | 637 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR4672-201 | ENST00000583126 | 81 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC008162.2-201 | ENST00000613352 | 291 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL136221.1-201 | ENST00000621449 | 509 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01592-202 | ENST00000518540 | 2367 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LMBRD1-201 | ENST00000370570 | 2099 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ESF1-202 | ENST00000617257 | 1470 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | HERC4-201 | ENST00000277817 | 4371 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LUZP4-201 | ENST00000371920 | 1701 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC026241.1-201 | ENST00000517873 | 2142 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PRKG1-205 | ENST00000401604 | 5922 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORA68.1-201 | ENST00000364537 | 132 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR450B-201 | ENST00000401182 | 78 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP184-201 | ENST00000411071 | 108 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513043.1-201 | ENST00000439124 | 535 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL441985.1-201 | ENST00000457727 | 251 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MED28P2-201 | ENST00000475771 | 317 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025524.1-201 | ENST00000518489 | 606 nt | TSL 4 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC091944.1-201 | ENST00000521984 | 449 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC025423.5-201 | ENST00000550230 | 219 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL670379.10-201 | ENST00000604330 | 253 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL670379.9-201 | ENST00000605428 | 253 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CYLC1-202 | ENST00000621735 | 379 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | BCHE-201 | ENST00000264381 | 2454 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZMYM1-201 | ENST00000359858 | 4175 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PKHD1L1-201 | ENST00000378402 | 13076 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DCLRE1A-202 | ENST00000369305 | 4241 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CEP85L-202 | ENST00000368488 | 7118 nt | TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-254P-201 | ENST00000363377 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.160-201 | ENST00000363677 | 92 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-805P-201 | ENST00000365643 | 106 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | Y_RNA.414-201 | ENST00000384011 | 101 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-748P-201 | ENST00000384648 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SNORD73A-201 | ENST00000386062 | 65 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MT-TL1-201 | ENST00000386347 | 75 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FGF7P8-201 | ENST00000402994 | 292 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6-1148P-201 | ENST00000410992 | 104 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL513185.2-201 | ENST00000425543 | 193 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RAB6C-AS1-202 | ENST00000433431 | 123 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RPL23AP22-201 | ENST00000437556 | 453 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC004383.1-201 | ENST00000438135 | 289 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTCO3P18-201 | ENST00000440206 | 761 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC069540.2-201 | ENST00000441776 | 351 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC02264-201 | ENST00000442020 | 576 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GAS5-221 | ENST00000450589 | 632 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |