Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CCDC142Q17RM4 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC142Q17RM4 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
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