Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NKX1-1Q15270 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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