Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
NFIXQ14938 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIXQ14938 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.4 ms