Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
CACNA1CQ13936 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms