Protein–RNA interactions for Protein: Q13439

GOLGA4, Golgin subfamily A member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA4Q13439 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
GOLGA4Q13439 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
GOLGA4Q13439 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms