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| PTK7 | Q13308 | UGT2A3-201 | ENST00000251566 | 2965 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | PREPL-205 | ENST00000409411 | 4725 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | KNTC1-204 | ENST00000436959 | 2412 nt | TSL 2 BASIC | 4.7 | □□□□□ -1.66 | | |
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| PTK7 | Q13308 | OR8K3-203 | ENST00000641662 | 2438 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | AKAP11-201 | ENST00000025301 | 9920 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZCCHC10-201 | ENST00000324170 | 2178 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | MYOT-201 | ENST00000239926 | 2337 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | SUPT16HP1-201 | ENST00000537175 | 3133 nt | BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
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| PTK7 | Q13308 | C5orf63-205 | ENST00000535381 | 5680 nt | TSL 3 BASIC | 4.68 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | CNOT1-201 | ENST00000317147 | 8471 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | MARCH1-201 | ENST00000274056 | 5367 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | FANCI-202 | ENST00000310775 | 4743 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | HTR2B-201 | ENST00000258400 | 2246 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA25.1-201 | ENST00000362326 | 128 nt | BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-626P-201 | ENST00000363354 | 107 nt | BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
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| PTK7 | Q13308 | BPY2DP-201 | ENST00000422208 | 265 nt | BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL451129.1-201 | ENST00000437471 | 285 nt | TSL 3 BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01162-201 | ENST00000447262 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |
| PTK7 | Q13308 | RPL39P29-201 | ENST00000447779 | 157 nt | BASIC | 4.67 | □□□□□ -1.66 | | |