Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SEMA3BQ13214 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
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SEMA3BQ13214 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SEMA3BQ13214 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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SEMA3BQ13214 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SEMA3BQ13214 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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