Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
NFIAQ12857 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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NFIAQ12857 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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NFIAQ12857 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
NFIAQ12857 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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