Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
RBBP4Q09028 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms