Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
FAM3BP58499 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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