Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PSEN1-201ENST00000324501 6078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
HOXD11P31277 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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