Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
J3KRW8 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
J3KRW8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
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