Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFG3L2Q9Y4W6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AFG3L2Q9Y4W6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms