Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HECTD4Q9Y4D8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms